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        盤點 | 天昊微生物組(擴增子/宏基因組)+代謝組客戶高分文章(醫學/食品/農學)

        發稿時間:2022-09-20來源:天昊生物

        隨著科學研究的不斷深入,單一組學的結果越來越難以滿足研究者對復雜生理過程調控機制的探究要求。多組學方法可以通過對多種組學數據的聯合分析,更加全面的反映生物體內潛在的調控網絡機制,提供了更多不同層次的結果證據。在多組學策略中,利用微生物組學(擴增子/宏基因組)和代謝組學聯合分析的方法,是近幾年的熱門手段。今天小編就和大家來盤點一下天昊生物客戶利用這兩種組學技術在醫學、食品和農學領域取得的成績。

        英文題目:Multi-omics reveals that Bifidobacterium breve M-16V may alleviate the immune dysregulation caused by nanopolystyrene

        中文題目:多組學研究揭示短雙歧桿菌M-16V可能緩解納米聚苯乙烯引起的免疫失調

        發表期刊:Environment International

        影響因子:13.352 JCR分區:Q1

        發表時間:20225

        研究目的:探究短雙歧桿菌M-16V是否可以緩解微塑料納米聚苯乙烯(PS)的毒性

        樣本類型:小鼠糞便

        檢測方法:16S擴增子測序(V3-V4區) + LC-MS非靶向代謝組

        取樣策略:16S3個分組 x 6個重復;代謝組:2個分組 x 8個重復

        研究內容:

        研究利用兩月齡的ICR小鼠(雄性和雌性)隨機分為三組(每組8只):對照組(芝麻油)、暴露組(PS處理)和干預組(PS+M-16V處理)。這些組分別簡稱為對照組(Control)、暴露組(PS)、干預組(M-16V/PS+M-16V)。暴露一個月后,對小鼠實施安樂死并收集組織,糞便和腸道儲存在-80°C,用于分析16S rDNA基因測序、組織病理學切片和RT-PCR。

        研究結論:

        在本研究探討了PS對免疫和微生物的影響,并通過多組學分析評估PS可能引起的小鼠健康問題。實驗還試圖揭示M-16V在維持宿主免疫系統和微生物組成之間平衡的重要功能。結果表明,PS改變了微生物組成,擾亂了氨基酸合成,增強了Th2炎癥反應,導致免疫紊亂。而M-16V顯示出對Th2Th17淋巴細胞亞群的抑制作用,伴隨著MyD88表達的激活和IL-12的產生。此外,M-16V可能通過降低普雷沃氏菌、艾森伯格氏菌的相對豐度來部分恢復腸道菌群的生態失調。結果表明,短雙歧桿菌M-16V通過宿主-微生物組相互作用具有一定的抗炎和免疫調節功能。


        英文題目:The gut microbiota during the progression of atherosclerosis in the perimenopausal period shows specific compositional changes and significant correlations with circulating lipid metabolites

        中文題目:圍絕經期動脈粥樣硬化進展過程中的腸道微生物群顯示出特定的組成變化,并與循環脂質代謝物顯著相關

        發表期刊:Gut Microbes

        影響因子:9.434 JCR分區: Q1

        發表時間:20211

        研究目的:探討小鼠動脈粥樣硬化(AS)與圍絕經期腸道菌群的關系

        樣本類型:小鼠糞便及血清樣本

        檢測方法:糞便16S擴增子測序(V3-V4區) + 血清脂質代謝組

        取樣策略:16S和代謝組:4個分組 x 8個重復;4個分組 x 5個重復

        研究內容:

        本研究利用8只雌性C57BL/624ApoE-/-小鼠,對其中的16ApoE-/-小鼠進行雙側卵巢切除術(OVX),其中8只進行90天的喂食高脂飲食(HFD),另外8ApoE-/-小鼠進行假手術并喂食HFD 90天,8C57BL/6小鼠作為對照組,進行假手術,維持正常飲食。其中8ApoE-/-小鼠每天灌胃雌激素(E),持續90天。其他小鼠每天灌胃無菌羧甲基纖維素鈉。在另一項獨立實驗中,20ApoE-/-小鼠接受雙側卵巢切除術和HFD喂食90天。這些小鼠接受不同處理小鼠糞便的糞菌移植(FMT)實驗,并進行糞便16S擴增子測序和血清脂質代謝組檢測。

        研究結論:

        本研究首次報道了在圍絕經期小鼠AS的進展過程中,腸道微生物群的特定變化伴隨著血液脂質代謝物的變化。此外,分析腸道微生物群和脂質代謝組學之間的相關性表明,腸道微生物群在絕經期間的有益調節作用可能通過減輕脂質代謝紊亂來降低圍絕經期心血管疾病的風險。此外,補充雌激素顯著抑制更年期AS進展、高膽固醇血癥和脂質代謝紊亂,也明顯調節腸道微生物群。此外,通過糞便微生物群移植干預腸道微生物群足以改善絕經后小鼠的血脂、AS癥狀和脂質代謝紊亂。絕經期間補充雌激素可通過調節腸道菌群來延緩AS的進展并糾正脂質代謝紊亂。值得注意的是,這些發現為雌激素替代療法提供了理論支持,并為了解圍絕經期綜合征提供了關于腸道微生物群和脂質代謝的詳細實驗證據。

        英文題目:Exposure to a mixture of cigarette smoke carcinogens disturbs gut microbiota and influences metabolic homeostasis in A/J mice

        中文題目:接觸香煙煙霧混合致癌物會擾亂腸道微生物群并影響小鼠體內的代謝穩態

        發表期刊:Chemico-Biological Interactions

        影響因子:5.168 JCR分區: Q1

        發表時間:20218

        研究目的:探討香煙煙霧致癌物對肺癌小鼠模型腸道微生物的影響

        樣本類型:小鼠糞便樣本

        檢測方法:糞便16S擴增子測序(V3-V4區)+糞便LC-MS非靶向代謝組

        取樣策略:16S和代謝組:2個分組 x 7個重復

        研究內容:

        本研究利用對5-6周齡雌性A/J小鼠喂食AIN-93G食物。馴化1周后,將所有小鼠隨機分為2組:對照組(小鼠口服等體積羧甲基纖維素鈉水溶液)NNK-BaP(小鼠口服NNK 2μmol+BaP 2μmol混合物,每周2次,共8)。然后,在實驗期間,小鼠被切換到AIN-93 M食物。處理結束時,處死小鼠并收獲肺組織,對獲得的不同組別小鼠肺部組織進行病理檢測、糞便微生物群16S rRNA測序和糞便非靶向代謝組學分析。

        研究結論:

        本研究發現放線菌、雙歧桿菌和腸桿菌水平的升高,以及理研菌、內臟異味桿菌和Acetatifactor菌水平的降低與NNKBaP觸發的肺癌有關。代謝組學圖譜揭示了相關的代謝調控,包括嘌呤代謝、苯丙氨酸代謝、初級膽汁酸生物合成、類固醇激素生物合成、不飽和脂肪酸生物合成、亞油酸代謝等。本文的結果可以為使用腸道微生物作為生物標志物來評估肺癌的進展提供一些指導,并為未來控制該疾病的發展帶來了干預靶點。

        相關文章鏈接:

        祝賀!天昊16S擴增子+宏基因組+代謝組助力漿水酸奶研究登陸一區雜志《npj Biofilms and Microbiomes》;

        祝賀!天昊Accu16S細菌絕對定量測序項目登陸頂級環境雜志《Journal of Hazardous Materials》;

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